Коронавирус 2019-nCoV Романско друштво за микробиологија

Автор: проф. Д-р Симона Руш, УМФ Керол Давила, Институт за вирусологија „Штефан С Николау“

Нов коронавирус, привремено именуван 2019-nCoV, поврзан со тешки респираторни инфекции кај луѓето, беше идентификуван во јануари 2020 година во Вухан, провинцијата Хуабеи, Кина. Епидемија на 44 случаи на атипична пневмонија беше пријавена во СЗО на 31 декември 2019 година, но има хоспитализирани случаи од 1 декември 2019 година.

Заклучно со 2 февруари 2020 година, во Кина се пријавени повеќе од 14.500 потврдени случаи и 304 смртни случаи, како и 146 случаи со 1 смрт во други 23 земји во Азија, Австралија, Европа и Северна Америка. Бројките брзо се менуваат од ден на ден, а една студија објавена во „Лансет“, заснована на математичко моделирање, проектира повеќе од 78.000 случаи, со експоненцијален раст во повеќе големи градови во Кина, за период од 1- 2 недели далеку од случаите на Вухан, со висок ризик од глобално ширење во отсуство на силни мерки за ублажување на преносот и епидемиски врв во првата половина на 2020 година.

Новиот коронавирус 2019-nCoV првично беше идентификуван со NGS секвенционирање (со комбинација на Илумина и Нанопор) и изолиран во Кина на примарни култури на човечки респираторни епителни клетки. Претходно, два други зоонотични коронавируси, најверојатно од лилјаци, произведоа тешки респираторни епидемии:

САРС-CoV (Тежок акутен респираторен синдром Cov) идентификуван во 2002 година во јужна Кина, во регионот Гунагдонг, кој брзо се рашири на глобално ниво и до моментот на истребување во 2004 година, предизвика повеќе од 8.000 случаи на смртност и смртта на 774 лица (смртност од 9,5%);
MERS CoV (Средноисточен респираторен синдром коронавирус), идентификуван во 2012 година во Саудиска Арабија, широко распространет во 27 земји, сè уште циркулира на Блискиот исток и досега резултираше со 2521 случај и 919 смртни случаи (35% смртност), исто така поврзано со гастроинтестинални симптоми и акутна бубрежна инсуфициенција.

Преносливост
Повеќето првични случаи предизвикани од 2019 година во CoV беа поврзани со локален пазар на продажба на живи животни, егзотично животинско месо и свежа морска храна [19, 20], што сугерираше зоонотичен пренос на вирусот од еден на друг вид. непознат Во моментов, сепак, во Кина има постојан меѓучовечки респираторен пренос, а во други земји се случија неколку секундарни случаи на меѓучовечко пренесување. Некои извештаи покажуваат дека вирусот може да се пренесе и од лица во инкубација (чие траење се проценуваше на 2,5-9 дена). Вистинската стапка на лесни, нехоспитализирани инфекции сè уште не е позната, но се чини дека може да има асимптоматски инфекции, од кои е тешко веројатно пренесувањето. MERS CoV често предизвикуваше асимптоматски инфекции, додека САРС CoV скоро никогаш.

Ниту еден од трите зоонозни коронавируси се чини дека нема голема заразност, со проценка на стапката на репродукција R0 да биде 2,4-2,68 за 2019 nCoV. Респираторниот пренос, преку капки Pfluge или фомити, е доминантен за сите 3 зоонозни коронавируси. Во случај на САРС CoV и МЕРС CoV, секундарниот пренос беше главно интрахоспитален, аеросолите генерирани за време на медицински процедури како што се ендотрахеална интубација, бронхоскопија, администрација на аеросолизирани лекови) го олеснија ширењето на болеста.

И кај САРС и кај МЕРС имало таканаречени „суперхенери“ пациенти кои елиминирале многу високо ниво на вирус, генерирајќи импресивен број на секундарни случаи. Во случајот на САРС, беше потенциран и можниот фекално-орален пренос, од случаите со обилна, водена дијареја. Во станбен комплекс во Хонг Конг (Амој Гарден) не се забележани помалку од 300 случаи на САРС, пренесени од пациент со дијареја, кој ја контаминирал канализацијата на зградата, вирусот е изолиран од канализацијата на бањите.

Потекло
Геномската анализа покажа дека 2019-nCoV е посебен бета-коронавирус од коронавирусите SARS CoV и MERS CoV. Сите три зоонозни коронавируси имаат лилјаци како резервоари, но тие потекнуваат од различни видови и им биле пренесени на луѓето преку среден домаќин. Сè уште е непознато за 2019-nCoV, додека за САРС CoV е претставено со цивет (палмино цветче), а за MERSCoV со камила. Филогенетските анализи покажуваат неодамнешно воведување на 2019-nCoV кај човечката популација, како и сродство со коронавирус претходно изолиран од лилјаците во провинцијата Јунан (BatCoV RaTG13), на кој има 96,3% генетска сличност.

Резултатите од секвенционирање широк геном покажуваат дека 2019-nCoV е посебна обвивка од другите коронавируси слични на САРС кај лилјаците и не е рекомбинантна меѓу другите коронавируси на луѓе или животни, како што сугерираат прелиминарните студии засновани на анализа на секвенци на вирусни гликопротеини.

Клеточни рецептори
САРС CoV користи металопептидаза ACE II (ензим конвертирачки ангиотензин 2) присутен во епителните клетки на долните дишни патишта, што би ја објаснило изразената екскреција на вирусот за време на болеста (по 10 дена од почетокот) и фреквенцијата на пренесување во болница., со постапки за генерирање на аеросол. Некои прелиминарни студии сугерираат дека истиот рецептор ќе се користи до 2019 nCoV.
МЕРС Цов користи посебен рецептор, дипептидилпептидаза-DPP4 (CD26), кој се наоѓа во долниот респираторен тракт, особено на алвеоларните епителни клетки, но и во други ткива, што би ја објаснило честата поврзаност на респираторните симптоми со гастроинтестинални и акутна бубрежна инсуфициенција. Бројни студии разгледаа прекумерна експресија на оваа молекула кај пациенти со истовремени заболувања (дебелина, астма), истовремени вирусни инфекции и кај пушачи, за кои се смета дека се изложени на ризик за тешка еволуција на болеста.

Дијагнозата на инфекција со новиот коронавирус во моментов се заснова на откривање на вирусна нуклеинска киселина со PCR во реално време кај назофарингеален ексудат, броалвеоларна лаважа или трахеобронхијален аспират. Потребните протоколи и реагенси може да се добијат преку СЗО и ЦДЦ, САД. Тестовите за откривање на анти-2019-nCoV антитела може да се извршат наскоро, овозможувајќи проценка на серопреваленцата на инфекцијата и нагласувањето на асимптоматските инфекции. Неодамна 2019-nCoV беше изолирана на културните култури во Австралија, во Институтот за инфекција и имунитет на Питер Доерти во Мелбурн. Лабораторијата, прва надвор од Кина која доби вирусен сој од пациент, ќе работи со СЗО за дистрибуција на изолатот на други референтни центри.

Третман на зоонозни коронавирусни инфекции
Во моментов третманот е симптоматски и поддржувачки, нема етиолошки третман. Експериментално, голем број антивируси со широк спектар се тестираат за инфекции со коронавируси, вклучително и 2019- nCoV.
За инфекција со МЕРС CoV, комбинација на интерферон бета и инхибитор на протеаза (лопинавир во комбинација со фармаколошки засилувач - ритонавир - најчесто употребувана формула кај ХИВ инфекцијата) се тестира во клиничко испитување (ЧУДО) во Саудиска Арабија, што беше ефикасно витро. Студиите врз животни покажаа супериорен ефект на инхибитор на вирусна РНК полимераза - ремдесивир, кој ја подобрува функцијата на белите дробови и го намалува и вирусното оптоварување и оштетувањето на белите дробови.

Претходно, за време на епидемиите предизвикани од САРС CoV и МЕРС CoV, набationalудувачките студии покажаа некои поврзани клинички придобивки: пасивна имунопрофилакса заснована на администрација на плазма кај излекувани пациенти; комбинирана употреба на PEG IFN алфа и рибавирин, комбинирана употреба на високи дози на кортикостероиди и интерферон алфакон-1. Голем број традиционални кинески лекови се користат емпириски. Тековно скринирање на библиотеки и бази на податоци на хемиски соединенија за наоѓање на ефективни антивирусни потенцијали.

превенција
Во моментов нема вакцина против коронавирус. Прелиминарните студии беа извршени за време на епидемијата на САРС CoV, но беа напуштени по исчезнувањето на вирусот. Многу кандидати за вакцини во моментов се формулираат и тестираат во студии финансирани од фармацевтски компании и од NIH, САД, како и од глобалниот сојуз Цепи (партнерство помеѓу јавни, приватни, филантропски и граѓански организации) за иновации во подготвеност за епидемија.

Мерки за јавно здравје
СЗО на 30 јануари ја прогласи епидемијата генерирана од новиот коронавирус 2019-nCoV за меѓународна итна здравствена состојба. Ова ја сигнализира потребата за меѓународно координиран брз одговор, особено за да се спречи натрупување на случаи во региони со ограничени ресурси. Не се воведуваат ограничувања во сообраќајот на стоки и луѓе, но се очекува секоја земја да направи анализа на ризик и цена-корист на ваквите мерки. Секоја земја мора да биде подготвена за активен надзор, рано откривање, изолација и управување со случаи, идентификација на контакти и спречување на понатамошно ширење на инфекцијата со nCoV во 2019 година и мора да работи со СЗО.
Претходно, Кина воспостави целосен карантин за неколку метрополи (> 54 милиони луѓе), првиот беше Вухан, град со 11 милиони жители, каде што за првпат беше дијагностицирана инфекцијата. На 23 јануари, градскиот јавен превоз и воздушниот и железничкиот сообраќај од Вухан беа прекинати во обид да се запре ширењето на новиот коронавирус.

Голем број земји воведоа забрани за влез за луѓе со ризик од пренесување на новиот коронавирус. Овие мерки се оправдани ако се земе предвид начинот на кој еволуираше епидемијата САРС од 2003-2004 година, пример за тоа што значи појавен вирус во услови на глобализација, прекумерна урбанизација, со пренатрупаност и голема брзина на движење.

САРС беше препознаен кон крајот на февруари 2003 година, откако инфекциите беа дијагностицирани во Кина од ноември 2002 година, но не беа пријавени во СЗО. Индексот на случајот за пренесување на болеста надвор од континентална Кина бил 65-годишен лекар кој се грижел за пациенти со САРС во Гуангдонг. На 21 февруари 2003 година, тој престојувал во хотел во Хонг Конг, покажувајќи знаци на респираторна болест што започна пред 6 дена. Неговата здравствена состојба брзо се влоши, тој беше хоспитализиран еден ден подоцна, а почина на 4 март.

Во болницата се случија низа секундарни случаи и беа заразени 17 лица кои стапија во контакт со пациентот со индекс во хотелот, предизвикувајќи ја епидемијата во Хонг Конг. Некои од нив отпатуваа за Виетнам, Сингапур и Торонто, каде станаа извор на локални епидемии. На 28 февруари 2003 година, пациент со симптоми слични на грип бил примен во мала приватна болница во Ханој, Виетнам; Се разболуваат 60 члена на медицинскиот персонал. Д-р Карло Урбани, регионален службеник на СЗО, брзо воспостави целосен болнички карантин, со што се ограничи ширењето на болеста и го предупреди СЗО за новиот синдром. Тој самиот остана во болница до 11 март, кога отпатува за Бангкок, Тајланд; за време на летот станува симптоматичен, се изолира на аеродромот и умира по 18 дена, на 29 март 2003 година. На 12 март 2003 година, СЗО издаде глобално предупредување за јавно здравје, а три дена подоцна најголемата меѓународна мрежа на лаборатории за студија за новиот синдром, кој би го идентификувал САРС CoV.

Селективна библиографија
Се одржува посебна страница посветена на новиот коронавирус
Новинарство за медицина во Englandу Англија - https://www.nejm.org/coronavirus
Лансет https://www.thelancet.com/coronavirus
СЗО https://www.who.int/emergency/diseases/novel-coronavirus-2019
ЦДЦ https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nCoV/index.html
ECDC https://www.ecdc.europa.eu/en/geographic-distribution-2019-ncov-cases

Подолу се споменуваат најважните статии, а мислење за брзината на објавување објавија: Рубин Е.,., Баден Л.Р., Морисеј С, Кампион ЕВ. Медицински журнали и епидемија на 2019-nCoV. N Engl J Med. 2020 јануари 27. Дои: 10.1056/NEJMe2001329. [Epubahead of print] ПабМед PMID: 31986242

Изолација 2019-nCoV

Huу Н, hangанг Д, Ванг В, Ли Х, Јанг Б, Сонг Ј, haао Х, Хуанг Б, Ши В, Лу Р, Ниу П, hanан Ф, Ма Х, Ванг Д, Ксу В, Ву Г, Гао ГФ, Тан В; Тим за истражување и истражување на кинескиот роман коронавирус. Роман коронавирус од пациенти со пневмонија во Кина, 2019. N Engl J Med. 2020 јануари 24. дои: 10.1056/NEJMoa2001017. [Epub пред печатење] PubMed PMID: 31978945.
Чан FФ, Кок КХ, huу З, Чу Х, То КК, Јуан С, Јуен Кј. Геномска карактеризација на новиот хуман-патоген коронавирус за 2019 година изолиран од пациент со атипична пневмонија по посетата на Вухан. Emerg Microbes Infect. 2020 декември; 9 (1): 221-236. дои: 10.1080/22221751.2020.1719902. PubMed PMID: 31987001.
Чен Y, Liu Q, Guo D. Појавувачки коронавируси: структура на геном, репликација и патогенеза. Ј Мед Вирол. 2020 јануари 22. дои: 10.1002/jmv.25681. [Epub пред печатење] Преглед. PubMed PMID: 31967327.

Еволуцијата на епидемијата

Клиника за инфекции

Хуанг Ц, Ванг Ј, Ли Х, Рен Л, haао Ј, Ху Ј, hangанг Л, Фан Г, Ксу Ј, Гу Х, ЧенгЗ, Ју Т, Ксиа Ј, Веи Ј, Ву В, Кси Х, Јин В, Li H, Liu M, Xiao Y, Gao H, Guo L, XieJ, Wang G, Jiang R, Gao Z, Jin Q, Wang J, Cao B. Клинички карактеристики на пациенти заразени со нов коронавирус во 2019 година во Вухан, Кина. Лансет. 2020 јануари 24. pii: S0140-6736 (20) 30183-5. дои: 10.1016/S0140-6736 (20) 30183-5. [Epub пред печатење] PubMed PMID: 31986264.
Чан FФ, Јуан С, Кок КХ, То КК, Чу Х, Јанг Ј, Ксинг Ф, Лиу Ј, Јип ЦЦ, Паун РВ, Цои ХВ, Ло СК, Чан КХ, Паун ВК, Чан ВМ, ЈП ЈД, Каи ЈП, Ченг ВЦ, Чен Х, Хуик, Јуен Кј. Семеен кластер на пневмонија поврзан со новиот коронавирус во 2019 година што укажува на пренесување од личност до личност: студија за семеен кластер. Лансет. 2020 година 24 јануари. Pii: S0140-6736 (20) 30154-9. дои: 10.1016/S0140-6736 (20) 30154-9. [Epub пред печатење] PubMed PMID: 31986261.

Потекло на вирусот и клеточните рецептори

Корман В.М, Ландт О, Кајзер М, Моленкамп Р, Мејер А, Чу ДК, Блејкер Т, Брунинк С, Шнајдер Ј, Шмит МЛ, Мулдерс ДГ, Хагманс БЛ, ван дер Веер Б, ван ден Бринк С, Вијсман Л, Годерски G, Romette JL, Ellis J, Zambon M, Peiris M, Goossens H, Reusken C, Koopmans MP, Drosten C. Откривање на роман-вирус во 2019 година (2019-nCoV) со реално време RT-PCR. Евро анкета. 2020 јануари; 25 (3). дои: 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.3.2000045. PubMed PMID: 31992387.

Историјат на епидемијата САРС и МЕРС