Каталитичка тријада - биологија
Кога каталитичка тријада Во биохемијата, ова е специјален аранжман на три аминокиселини што карактеризира некои од активните центри на ензими. Каталитичка тријада се наоѓа во серинските протеази; И каталитичките тријади и дијадатите се наоѓаат во тиол и цистеин протеази.
градба
Структура во серински протеази
Кај серинските протеази, каталитичката тријада се формира од аспартат, хистидин и серин, чии остатоци од аминокиселини се поврзани со водородни врски. Аспартатскиот остаток се наоѓа во џеб недостапен за растворувачот и формира водородна врска со групата N-H на остатокот од хистидин. Хистидинот поларизиран на овој начин, пак, формира водородна врска со вториот азот поврзан со прстен со групата ОХ на серинскиот остаток. Врската со водород и кислород е силно поларизирана и нуклеофиличноста на кислородот дополнително се зголемува.
Структура во тиол и цистеин протеази
И каталитичките ди- и тријади се јавуваат кај тиол и цистеин протеази. Каталитичката дијада се состои од цистеин и хистидин, тријада на цистеин-хистидин-аспарагин/аспартат/глутамин или глутаминска киселина.
Механизам за катализа
Серинските протеинази, како ендопептидази, го катализираат хидролитичкото расцепување на пептидните врски во протеините. По формирањето на ензим-супстратниот комплекс, се случува нуклеофилен напад на серискиот кислород врз карбонил јаглеродот на пептидната врска со формирање на ковалентен тетраедрален среден медиум. Водородот се пренесува од водородниот мост до хистидинот. Во вториот чекор, хидрогенот што штотуку е пренесен се користи за протонирање на пептидниот азот, со што се крши пептидната врска. Како резултат на Н-терминалот на расцепениот протеин се дифузира и се заменува со вода од растворувачот. Водородна врска со остатокот од хистидин овозможува нуклеофилен напад на вода врз карбонил јаглерод поврзан со серин. Откако водородот е целосно пренесен во хистидин, последниот чекор е формирање на оригинална водородна врска помеѓу серинот и хистидинот, при што ковалентната врска со подлогата е расцепкана и новоформираниот С-крај на расцепениот протеин може да се шири. Поради ковалентните средни фази, механизмот спаѓа во групата на ковалентни катализа, додека влијанието на аспартатниот остаток врз хистидинот претставува електростатска катализа.