Изненадувачко откритие за ХИВ
Научниците веруваат дека ХИВ или вирусот на човечка имунодефициенција, кој предизвикува СИДА, започнал да инфицира луѓе во регионот на Централна Африка некаде во раните 1900-ти, ширејќи се на луѓето од шимпанзата. Постои период од најмалку 80 години од времето кога ХИВ вирусот започна да се пренесува на луѓето до неговото откривање и затоа најголемиот дел од динамиката на мутации претрпена од овој вирус на почетокот останува непозната.
Неодамна, сепак, најстариот скоро комплетен геном на ХИВ вирусот е откриен во Демократска Република Конго, во заборавен примерок од ткиво датирајќи од 1966 година, скоро две децении пред официјално откривање на ХИВ вирусот, пренесува Агерпрес. Информацијата ја објави Live Science повикувајќи се на студија објавена во најновиот број на Зборникот на трудови на Националната академија на науките.
Примерокот од ткиво е земен и зачуван во 1966 година, со што овој ХИВ вирусен геном е 10 години постар од најстариот познат ХИВ геном до сега (од примерок од крв собран во 1976 година од ДР Конго).
Зошто е важно да се следат генетските мутации на вирусот
Таквите геномски секвенци, кои доаѓаат од периодот пред откривањето на вирусот кој предизвикува СИДА (откритие што се случи во 1983 година), придонесува за идентификување на генетски мутации претрпени од овој вирус. За возврат, овие мутации им помагаат на истражувачите да следат како се шири ХИВ и кога започнал да ги инфицира луѓето.
Од оваа гледна точка, новооткриената геномска низа е многу релевантна, според Софи Гризелс, коавтор на новата студија и постдокторски истражувач за еволутивна и компјутерска вирусологија на Католичкиот универзитет во Лувен (КУ Левен), Белгија. Оваа низа одговара на начинот на кој истражувачите го утврдија периодот на појава на ХИВ кај луѓето, рече таа во изјавата за Live Science.
„Добро е да се знае, бидејќи тоа значи дека нашите еволутивни модели што ги применуваме на вирусната низа функционираат добро. Не наидов на некое големо изненадување “, подвлече таа.
Постојат неколку видови на ХИВ, но подгрупата одговорна за 95% од случаите на СИДА во светот е ХИВ-1 група М. Готово 32 милиони луѓе целиот свет почина од СИДА од почетокот на оваа пандемија.
И како постои период од најмалку 80 години од времето кога ХИВ вирусот започна да се пренесува на луѓето до неговото откривање, голем дел од динамиката на мутациите претрпени од овој вирус на почетокот останува непозната.
Кога вирусот стана вирулентен?
Математичките модели на стапката на мутации во вирусот даваат некои индиции за тоа кога започна пренесувањето на ХИВ од човек на човек, што потоа се претвори во пандемија. Но, останува едно прашање: кога и зошто ХИВ-1 подгрупата М стана толку плодна што успеа да зарази толку многу луѓе на глобално ниво.?
Дел од овој проблем е што математичките модели кои успеваат да ја пресметаат стапката на мутации претрпени од вирусот во последните години стануваат многу помалку точни кога ќе бидат земени предвид подолги временски периоди, според Софи Гризелс. Ова е поврзано со фактот дека генетските информации се губат за подолги временски периоди. Одредени вирусни соеви исчезнуваат едноставно поради природна селекција или едноставно поради случајни фактори, не оставајќи трага од нивното постоење во геномите на моментално циркулирачките вируси.
Од оваа причина, откривањето на антички вирусен вид е како откритието на Археоптериксот за палеонтолозите. Тоа недостасува дел од сложувалката за тоа како се развило тоа семејство на вируси со текот на времето.
Софи Гризел се приклучи на тековниот проект предводен од биологот Мајкл Воробеј од Универзитетот во Аризона и, заедно со други истражувачи од Белгија, САД и ДР Конго, анализираа 1.645 примероци на биопсија на ткиво од регионот на Централна Африка за време на Земените примероци беа зачувани во формалин и потоа беа покриени со парафински восок. Потоа, користејќи PCR тестови (слични на оние што се користат за откривање на новиот коронавирус), истражувачите барале траги од геномот на ХИВ. На крајот откриле само една таква трага: вирусна низа во биопсија на лимфен јазол од 38-годишен маж.
Зошто новото откритие е важно и што истражувачите треба да утврдат
Постојат и постари вирусни фрагменти од ХИВ - еден од 1959 година и друг од 1960 година, исто така од ДР Конго. Но, овие се делумно и по дифолт не можат да обезбедат информации за мутациите што ги претрпел овој вирус со текот на времето. Овие два фрагменти се исто така дел од различни подвидови на ХИВ, според Гризел, што го докажува тоа овој вирус циркулираше кај луѓето уште од педесеттите години на минатиот век.
Следната цел на истражувачите е да дознаат кога ХИВ-1 вирусот започна брзо да се шири, епидемиски. Можеби имало некои промени во геномот на вирусот ХИВ-1 што го направи поефикасен, според Софи Гризелс. Но, поверојатно, промени во човечкото општество го овозможија ова.
урбанизација рапидно растеше на почетокот на дваесеттиот век во Централна Африка.
Помеѓу 1910 и 1950 година, јавно-здравствените кампањи станаа достапни третмани за состојби како маларија, нарушувања на спиењето и сифилис. Но, многу од овие кампањи не користеа стерилизирани медицински инструменти ефикасно, што можеше да доведе до ширење на ХИВ.