Потеклото на изметот; Порака @ Археологија на Интернет
Новиот метод за диференцирање на изворите на палеофекална материја обезбедува важни информации за истражувачите
Изметот е сеприсутен во археолошките записи и е потенцијален рудник за злато за знаење за исхраната и здравјето во тоа време, развојот на паразити и екологијата и еволуцијата на микробиомот. Главниот проблем на истражувачите е да утврдат чиј отпад всушност се изучува. Една нова студија предводена од Максим Бори и Кристина Воринер од Институтот за хумана историја Макс Планк (MPI-SHH) во Јена сега претставува »coproID« сигурен метод за утврдување на потеклото на палеофекалната материја.
Машинското учење овозможува сигурна класификација
По илјадници години, утврдувањето на потеклото на изметот може да биде тешко. Особено, разликата помеѓу измет од човек и куче е комплицирана, бидејќи и двете се слични по големина и форма, се јавуваат на истите локации и имаат споредлив состав. Овој проблем се надополнува со фактот дека кучињата биле на менито на многу претходни општества и дека кучињата имаат тенденција да јадат човечки измет. Едноставните генетски тестови се проблематични бидејќи можат да детектираат ДНК на двата вида.
Со цел да се добие пристап до наодите содржани во палеофекалната материја, меѓународниот истражувачки тим на научници од MPI-SHH, Универзитетот Харвард и Универзитетот во Оклахома развија coproID (идентификација на копролит). Методот е комбинација на анализа на старата ДНК-домаќин со софтвер кој користи машинско учење за да ги препознае микробиомите во измет. Со примена на coproID и на ново секвенционирани и веќе објавени множества на податоци, тимот беше во можност со сигурност да го утврди потеклото на археолошките измет и да покаже дека комбинацијата на ДНК-домаќин и различните колонии на микроби кои живеат во луѓето и кучињата, овозможува точна диференцијација на нивните измет.
Класификацијата дава увид во здравјето на дигестивниот систем
„Неочекуван резултат на нашата студија е дека археолошките откритија покажуваат голем дел од измет од кучиња“, вели проф. Кристина Воринер, главен автор на студијата. Воин, исто така, очекува дека coproID ќе најде уште поширок спектар на апликации, на пример во форензика, екологија и истражување на микробиоми.
Способноста прецизно да се утврди потеклото на археолошкиот измет овозможува директно проучување на промените во структурата и функцијата на човечката цревна флора со текот на времето. Истражувачкиот тим се надева дека ова ќе овозможи увид во нетолеранцијата на храна и другите проблеми со здравјето на луѓето. „Идентификувањето човечки котролити треба да биде првиот чекор во анализата на античките човечки микробиоми“, вели Максим Бори, првиот автор на студијата.
„Со повеќе податоци за метагеномите на цревната флора на не-западнати кучиња, сега можеме безбедно да класифицираме дури и повеќе примероци од измет како измет од куче, а не само како„ небезбедни ““, додава Бори. Како што се зголемува количината на податоци, се очекува класификацијата според coproID, а со тоа и поддршката на истражувачите кои наидуваат на палео-фекалии во голем број историски и географски контексти, и понатаму да се подобрува.