Визуелизирање на сличноста на човечката и хемиската ДНК; EWSTпреведи

Универзитет во Калифорнија - Риверсајд
Риверсајд, Калифорнија 92521

сличноста

Неодамнешното објавување на целосниот геном на шимпанзата, обележано со прашање на природата, ни кажува дека луѓето и шимпанзата имаат 96% ист генетски материјал. Овој број е тешко разбирлив, што значи дека делиме 96% од нашата ДНК со нашите најблиски братучеди.?

Директното истражување на ДНК не е корисно. На пример, разгледајте ги првите 100 базни парови на полето на митохондријалната ДНК:

gtttatgtagcttaccccctcaaagcaatacactgaaaatgtttcgacggggtttacatcaccccataaacaaacaggtttggtcctagcctttctcttattag

и првите 100 основни парови на човечка митохондријална ДНК:

gatcacaggtctatcaccctattaaccactcacgggagctctccatgcatttggtattttcgtctgggggggggggacgcgatagcattgcgagggg

Сличноста е многу тешко да се процени, а целосниот геном и за луѓето и за шимпанзата е всушност околу 3 милијарди долги базни парови.!

Изградивме едноставна алатка за да им овозможиме на луѓето да ја визуелизираат и разберат сличноста/различноста на ДНК секвенците. Додека овој труд е моментално необјавен и сè уште е во тек, објавивме видео за ДНК на човекот и шимпанзата, што се совпаѓа со објавувањето на целосниот геном на шимпанзата.

Видеото трае околу 2 минути и е целосно автономно. Подолу е верзијата на YouTube, можеби претпочитате да ги гледате самостојните верзии со поголема резолуција подолу.

  • Гугл Видео е тука .
  • Репродукција на верзијата Quicktime во прелистувачот: Внимание, со најдобар квалитет, но голема датотека. Можеби ќе потрае неколку минути пред да се репродуцираат видеата.
  • Репродуцирајте ја AVI верзијата во прелистувачот.
  • Репродуцирајте ја верзијата MP4 во прелистувачот.
  • Десен-клик за да ја преземете верзијата на Quicktime: Внимание, голема датотека (бесплатен плеер).
  • Десен клик за да ја преземете верзијата AVI
  • Десен клик за да ја преземете верзијата MP4

Кратка биографија на учесниците:

  • Д-р Имон Киог е доцент по компјутерски науки на УЦЦ. Неговите истражувачки интереси вклучуваат рударство на податоци и визуелизација.
  • Д-р Стефано Лонарди е асистент професор по компјутерски науки на UCR. Неговите истражувачки интереси вклучуваат пресметковна молекуларна биологија.
  • Д-р Виктор Б. Зордан е доцент по компјутерски науки на УЦЦ. Неговите истражувачки интереси вклучуваат компјутерска графика.
  • Д-р Санг-Хи Ли е асистент професор по антропологија на УЦЦ. Неговите истражувачки интереси вклучуваат човечка еволуција и таксономија.
  • Манел araара е студент на автономниот универзитет во Барселона и беше студент на УЦР во 2005 година.

Ако сакате да го споменете овој труд, користете:

E. Keogh, S. Lonardi, VB Zordan, SH Lee and M. Jara (2005). Визуелизирање на сличноста на човечката и хемиската ДНК. (Мултимедијално видео). http://www.cs.ucr.edu/

Благодарност до Колин Креншоу, Бил Јуан-чи Чиу и Анвар Ади за помош и предлози. Музиката во видеото е Шопен - Балад бр. 4 во Ф-мол, Оп.52, Анданте кон мото, изведена од д-р Санг-Хи Ли .