Терминатор (генетика) - биологија

Кога Терминатор или Терминатор на транскрипција е дел од генетска секвенца на ДНК што означува крај на ген или оперон. Тоа доведува до прекинување на транскрипцијата.

Две класи на транскрипциски терминатори се познати кај прокариотите:

  • Внатрешни терминатори на транскрипција
  • Троминатори на транскрипција зависни од Rho

Терминаторот обично се состои од кратка секвенца (4-10) од основни парови на ГЦ и се наоѓа во РНК скоро веднаш по кодонот на стоп, што го опишува крајот на ОРФ. Протеините кои го блокираат прекинувањето на транскрипцијата се нарекуваат антитерминатори.

Ро-независно раскинување

Со овој тип на завршување, се развива секундарна структура во форма на фиба во транскриптот на РНК. Причината лежи во посебната низа на бази.

Оптималната структура за внатрешен терминатор [1] резултира како што следува:

биологија

  • Богат регион ГЦ со формирање на вирус 1 (6-8 основни парови)
  • Регион за формирање јамка (3-5 базни парови)
  • Богат регион ГЦ со формирање на напрегање 2 (6-8 основни парови)
  • Поли урацилен регион (3-8 основни парови)

Двата региони богати со ГК се здружуваат и го формираат таканаречениот трупец. Регионот помеѓу ја формира таканаречената јамка или јамка. Оваа структура на фиба резултира со долга пауза во издолжувањето. Ова корелира во директна пропорција со стабилноста на структурата на фиба. Следните 3-8 остатоци од урацил го дестабилизираат комплексот на издолжување [2]. Популарната теорија е дека структурата на фиба го скратува хибридот на РНК/ДНК и нестабилното спарување на АУ дополнително го дестабилизира комплексот. Последица на ова е отфрлање на записникот [3] .

Важноста на структурата на фиба за прекинување

Структурата на фиба придонесува за прекинување на два начина [4] [5]

  • Структурата на фиба на РНК доведува до алостерична инхибиција на додавање на нуклеотиди на активното место. Ова ќе го запре RNAP.
  • Структурата на фиба обезбедува одвојување на РНК - ДНК хибрид на крајот од 5’–.

Престанок зависен од Rho

За разлика од внатрешните терминатори, ро-зависното завршување не содржи никакви дестабилизирачки елементи на низата на ДНК. Тука престанокот е катализиран од факторот на завршување Rho. Комплексот на издолжување е дестабилизиран со активноста на хеликазата на факторот Ро [6]. Ро ги препознава деловите богати со Ц на преписот овде како хексамер. Се врзува за површина од околу 100 bp возводно од комплексот на издолжување на новосинтетизираниот РНК препис. Rho се движи кон крајот на 3 'од RNA поради нејзината активност на ATPase. Оваа активност на хеликаза на факторот на завршување доведува до одвојување на хибридот на РНК/ДНК. Последицата е дисоцијација на комплексот на издолжување и како резултат на тоа ослободување на РНК транскриптот [7] .

Разлика

Секвенците на терминаторот на ДНК треба да се разликуваат од кодоните на терминаторот на mRNA, што доведува до прекинување на преводот.