Биохемиска пракса II - PDF Бесплатно преземање
1 Биохемиска пракса II 3-недела стажирање во главниот курс по биохемија WS 2010/11 Институт за биохемија Биоцентар Макс-фон-Лау-Страже Франкфурт на Мајна Тел:
2 Содржина 1 Општ распоред Помош за создавање лабораториски протокол Биоинформатика Упатство за подготовка на пуфери Транспортер на пептиди ТАП Мембранска подготовка од клетки на инсекти Sf9 (Експеримент 1 А) Означување на пептиди со јодоацетамидофлуоресцеин (Експеримент 1Б) Одредување на афинитет на врзување (вредност на KPde на TAP) (Експеримент 1С) Истражување на врзувањето со нуклеотидите на ТАП (Експеримент 1Д) Анализа за транспорт на пептиди (Експеримент 1Е) Функционална карактеризација на доменот на врзување на нуклеотидите на МДЛ Преголема експресија на MDL1-NBD во E. coli (Експеримент 2А) Прочистување на MDL1-NBD или MDL1 (NBD99) (Експеримент 2Б) Тест на активност на АТПаза (Експеримент 2С) Димеризација на EQ мутантот (Експеримент 2Д) Калење на флуоресценција за да се одреди константната стапка на димеризација на MDL1 (E599Q) -NBD (Експеримент 2E)
4 Општо 3 Испитот за целата пракса БЦ-II (ПЕИ, ГШ, п.н.е.) и предавањето за биоаналитика ќе се одржи во петок, во 9:30 часот во зградата Биозентрум N100, просторија 0,15. Резултатите ќе бидат објавени во фоајето на Институтот за биохемија и ќе бидат објавени најдоцна на нашата веб-страница. За да го положите испитот, потребни се 50% од бодовите. Лидер за стажирање, проф. Роберт Тампе ПД. Д-р Руперт Абеле Супервизор Кристоф Балдауф Др. Катарина Чех Ирина Бангерт Волкер Гатердам Герда Гундиш Сабине Хулпке Кристин Киозе Александар Клефен Ноеми Лабрија Тим Лин Сабин Шмит Герхард Спац-Кимбел Франц Тумулка Агнес Викиск
9 Помош за креирање протокол за стажирање 8 Пример: BEISMANN-DRIEMEYER, S. and TAMPE, R. (2004): Функција на машината за транспорт на антигени TAP во клеточниот имунолошки систем Angew. Хеми 116, Библиографијата е подредена по азбучен ред според првиот автор! (За да ја креирате библиографијата, ја препорачуваме програмата Цитави (бесплатно на почетната страница на универзитетот). Ф. Додаток Во некои случаи следи додаток, кој обично се состои од подолги табели со податоци за мерење или поголеми бројки. Заклучок Кога го пишувате вашиот протокол, обидете се да бидете целосни и јасни Кога ќе завршите со читање на текстот за веродостојност, структура и формулација, како и за правописни грешки, прочитајте го текстот повторно и/или побарајте помош од некого! Коментар Ако има смисла, се охрабруваат отстапувања од овие упатства, креативноста не се казнува!
17 Биоинформатика 16 Оваа страница ви дава многу информации за ACE2, вклучително и набројување на протеинската низа (во кодот со една буква) и ДНК секвенцата. Што можете да кажете за функцијата на ACE2? Од кој организам бил клониран? Каде е објавен истражувачкиот труд? Забележете дека има врска до Медлајн, која ви овозможува да ја видите апстрактот на статијата.
18 Биоинформатика 17 Карактеристиките на низата вклучуваат региони како „cd“ (кодирање на ДНК секвенца). Ова ви го кажува регионот за кодирање на ДНК - регионот што е преведен за да се даде протеинската низа. На која позиција започнува и завршува редоследот на кодирање? Некои од записите на низата содржеа повеќе од еден ген. Погледнете го пристапниот број X (Може да го извршите пребарувањето повторно или да го користите копчето за враќање на прелистувачот за да го пронајдете). Прикажете ја оваа низа во графички формат (од врска близу до горниот дел од страницата). Треба да видите страница како оваа подолу. Истражете ги врските на оваа страница за да ги видите другите достапни информации за овој регион. Менијата Ограничувања и преглед/индекси (и командите за Полиња за пребарување) се многу покорисни при пребарување на базите на податоци за нуклеотиди и протеини отколку со литературните бази на податоци. Список со сите полиња за пребарување и нивните кодови што се користат во базите на секвенци, можете да ги најдете во упатството за помош на Ентрез тука. Пример: Користете ограничувања за да ги пронајдете сите човечки низи (со исклучок на EST и STS) додадени во базата на податоци од 1998 година:
20 биоинформатика Колку нуклеотидни низи (со исклучок на ЕСТ) од хлоропластите на тутунот има во базите на податоци? 5. Очигледно „Кралот“ се разгранил од анализа на рок-ен-рол до ДНК секвенца долго по неговата пријавена смрт. Пронајдете ги пристапните броеви на ДНК секвенците пријавени од Елвис Арон Присли. Задолжително читање: прирачник за помош на Ентрез Ентрез дел.